在男女性爱的过程中，在性器官的反复摩擦作用下，神经中枢受到刺激快达到高潮而且临近射精时，在腰部脊骨里的脊髓神经中枢的控制下，男性体内的一系列器官收缩，最终把各个器官内的液体排除，最后汇集到尿道，此时会膀胱关闭，同时也会使得相关肌肉收缩最后使得精液从体内射出。
正常情况下射精不仅不痛，而且使人感到有一种性快感，这也是男子在性交中所追求的享受之一。如果上述器官任何一处发生障碍，都会导致射精疼痛。
引起射精疼痛的原因主要有器质性和功能性、心理性三个方面
1)器质性：最常见的是精道的炎症，如附睾炎、前列腺炎、精囊炎、精阜炎、后尿道炎等，射精时的肌肉收缩引起疼痛。后尿道结石、尿道狭窄排精时受阻也可引起疼痛，射精管出现结石梗阻和先天性梗阻也会造成射精疼痛。
2)功能性：性交次数过频、新婚纵欲过度，尤其是白天性交后，会阴部或阴囊内酸痛。
3)心理性：一些人性格也好，或者因为性生活的一些失败也好，或者是一些工作精神压力等等，造成了过于为射精好坏而焦虑，诱发了会阴部肌肉的痉挛性收缩，特别紧张，这是一种心理因素所造成的。另外也有一些阴茎的头部特别的敏感，在手触动龟头的时候，有一种疼痛感，应该说也和心理因素有一定的关系，还有一些人是神经官能状，他的思想想到哪一个地方就容易造成疼痛。有的人头痛，一会儿就感到脑子疼，这跟心理因素有关系。
1、疾病因素
许多疾病也是可以导致男性存在射精疼痛的现象，这些疾病通常包括附睾、精囊、输精管、前列腺或后尿道等处的肿瘤，阻塞射精通道，射精时因刺激也可引起疼痛。
2、过度性生活
有些时候性生活过频也会导致男性出现射精疼痛的情况，由于男性朋友无节制的性生活这样一来会引起输精管、精囊及尿道器官产生无菌性炎症，致使这些器官充血水肿。
3、炎症因素
炎症就可以导致射精疼痛，这种炎症特别的多如尿道炎、精囊炎、附睾炎、胱炎、前列腺炎等疾病，当男性朋友出现射精疼痛的时候很有可能是这些炎症在作怪。
4、其他因素
对于射精疼痛的治疗主要有以下几种方法
1)、性交过频时，减少性交次数。
2)、因炎症引起的射精疼痛，应用抗生素治疗及理疗。
在生活中我们如磐石遇到射精疼痛这样的问题，这时候千万不要慌张，一定要正确的对待射精疼痛这种病情。当出现射精疼痛时首先要查找原因，如果夫妻分居后第一次性交，或性交次数减少后，射精疼痛减轻或停止，则是因性交过频引起的，则要减少性交次数，恢复一段时间，以保持性器官的充分休息，即可消除射精疼痛。