男性不育不是单一的特异性疾病，而是由多种病因导致的男性生殖器，包括内外生殖器和性腺轴不同水平的异常，最终表现为生育力下降或丧失的综合病症。正因为如此，对于男性不育症不可能用一种特效的药物或方法，有效治疗各种不同病因所致的男性不育症。相反，由于目前还未能认清全部男性不育的病因，因此，也就尚无肯定有效的治疗方法用于临床。目前在临床有一定疗效的治疗方法是：
A、内分泌治疗：克罗米芬治疗少精子症以及HCG和HMG合用治疗促性腺激素低下症。
B、生殖道炎症的治疗：目前主张联合应用抗生素与抗炎类药物。
C、免疫治疗：他莫昔芬减少抗精子抗体的产生，同时使用免疫制剂，可取得较好疗效。
D、辅助生殖技术(ART)：人工授精：进行夫精人工授精(AIH)及应用精液冷藏技术，对无精子症患者给予供精人工授精(AID);体外受精-胚胎移植及其衍生技术。
此外，尚有许多原因不明，诊断不明确的少精子症和弱精子症，统称为原因不明的男性不育症。此种情况的治疗方法繁多，但疗效不肯定，归纳有：激素、抗生素、甲状腺素、维生素、微量元素、氨基酸等药物，同时辅以劝告病人避免烟酒，防止精神紧张、过度疲劳以及保持正常营养和规律的生活习惯等。饮食中禁忌服用：芹菜、无鳞鱼类、棉子油;生活避免中射线辐射，睾丸不接触高温(如蒸气洗浴、泡浴、长时间坐位)。