包皮过长是男性生殖系统疾病中最为常见的一种，会对男性的生殖能力有一定的影响，有时候会导致男性不育症的出现，严重影响家庭和谐。包皮过长除了会导致男性不育之外，还会导致其他健康问题。
损害肾脏健康
由于阴茎发炎，可以引起尿道口或前尿道狭窄，造成排尿困难。长期排尿困难，肾脏的功能就会受到损害。这也是包皮过长最常见的危害之一。
破坏性生活
成年人会由于包皮过长或包茎，影响正常性生活。特别是包皮口径过小的男人，包皮上翻不能复原，包皮紧紧卡在冠状沟处，成嵌顿包茎，痛苦不甚。严重时，龟头会因血流不畅而发生水肿，甚至可发生龟头坏死。
使阴茎发炎
包皮过长的危害波及整个阴茎，因为包皮内有丰富的皮脂腺，能分泌大量的皮脂。包茎或包皮过长时，使包皮内皮脂腺的分泌物不能排出，皮脂和尿中的沉淀物合成乳酪状奇臭的“包皮垢”。包皮垢适宜细菌生长，故可引起阴茎头及包皮发炎。病菌通过尿道还可以造成尿路感染。发生在尿道口的炎症，愈合后可引起尿道口狭小，造成排尿困难。
有致癌风险
原来，男人包皮里面的包皮垢是一种致癌物质，据调查，85%—95%的阴茎癌患者，都是包茎或包皮过长。包茎和包皮过长，不仅影响自己的身体健康，如果和妻子同房，还会把包皮垢带入阴道，刺激子宫，诱发子宫颈癌。所以，包皮过长的危害不容忽视。
影响发育
包皮过长的危害最直接的影响，就是阴茎的生长发育，在青春期由于阴茎头被包皮紧紧包住，得不到外界的应有刺激，阴茎头的发育或受到很大束缚。