采用商环包皮环切术治疗包皮过长，术后可能会出现一些并发症，如术后疼痛、商环提前脱落、包皮水肿、阴茎皮肤损伤、包皮创缘裂开出血及感染等，当出现上述并发症时，应积极处理，避免加重患者不必要的痛苦。
1、术后疼痛。术后麻醉药作用消退后，患者会感觉疼痛，术后4～6天内疼痛最为明显。为减轻患者疼痛，术后可在医生指导下口服非甾体抗炎药镇痛，如每6小时服用复方氨基比林非那西丁片500mg，持续至少一天。术后夜间阴茎勃起时也可能引起疼痛，可采用局部冷敷的方法缓解。
2、商环提前脱落。应立即到医院将商环拆除，并积极预防伤口感染及出血，一般不需特殊治疗。
3、包皮水肿。包皮水肿是商环包皮环切术最常见的并发症，一般在拆环后发生，因水肿会随着时间的推移而逐渐消退，所以只需行保守治疗即可。
4、阴茎皮肤损伤。临床上较少见，多是因为手术操作不当，将阴茎皮肤夹入内外环之间造成的，一般不需要进行特殊处理，损伤可自行愈合。
5、包皮创缘裂开出血。若包皮创缘裂开而没有出血，或裂开小于1cm，不需要缝合；若创缘裂开伴有活动性出血，或裂开超过1cm，应间断缝合开口。
6、包皮创缘感染。若创口感染，患者可在医生指导下口服抗生素进行治疗，并增加换药次数。术后保持创口清洁干燥可减少感染的发生率。