月经是指子宫内膜周期性变化而出现的周期性子宫出血。正常月经周期是由丘脑下部－垂体－卵巢轴各个环节的内分泌功能所调节，如果任何一个环节发生障碍就会发生月经失调，有时导致闭经。不论是原发性和继发性闭经，其发生的原因既有共同之处也有不同之处。控制正常月经周期的主要环节有四个，某一环节发生故障就会出现闭经：
一、子宫性闭经闭经的原因在于子宫，月经调节功能正常，卵巢有功能，但子宫内膜对卵巢不能产生正常的反应，故称子宫性闭经。引起子宫性闭经的常见疾病有：
（一）子宫内膜损伤或粘连综合征常发生在人工流产后、产后出血或流产后出血刮宫以后，多是由于刮宫过度，损伤了子宫，造成宫腔粘连，出现闭经。
（二）子宫内膜炎最常见的导致闭经的子宫内膜炎是结核性子宫内膜炎，其他流产后或产后严重的子宫内膜炎也可发生闭经。
（三）子宫发育不全或缺如由于副中肾管发育不全或不发育而致子宫发育不全或不发育，往往表现为原发性闭经。
（四）子宫切除后或子宫腔内放射治疗后因生殖道疾病切除子宫后或因某些子宫恶性肿瘤经腔内放射治疗破坏子宫内膜后而出现闭经。
二、卵巢性闭经闭经的原因在于卵巢，卵巢性激素水平低落，子宫内膜不发生周期性变化而致闭经，常见的疾病有：
（一）先天性卵巢发育不全或缺如此时卵巢未发育或仅呈条索状无功能，多为原发性闭经，常见的疾病有：
1、性染色体异常
①最常见的有特纳综合症
②核嵌合型如45，XO/46，XY，45，XO/46，XX，45，XO/46，XXX，45，XO/47，XXX等。
2、性染色体正常如单纯卵巢发育不全。
（二）卵巢功能早衰妇女提早绝经，在40岁以前已绝经者，称为卵巢功能早衰（简称卵巢早衰）。患者表现出继发性闭经，并伴更年期综合征的有关症状如面部潮红、阵热、多汗、情绪波动等，内外生殖器官及第二性征逐渐萎缩及退化。
（三）卵巢切除或组织被破坏多由于手术切除双侧卵巢或双侧卵巢经放射治疗后，卵巢组织被破坏以致功能丧失，表现为原发或继发性闭经。严重卵巢炎症也可破坏卵巢组织而致闭经。
（四）卵巢功能性肿瘤产生雄激素的卵巢肿瘤由于过量的雄激素抑制了丘脑下部－垂体－卵巢轴的功能而致闭经。分泌雌激素的颗粒细胞瘤有时也可引起短暂闭经，是由于肿瘤持续分泌雌激素，抑制了排卵，出现子宫内膜增生过长而导致闭经。