这个问题，在学术界一直是存在争议的，因为通过座便器传染上性病的事例在临床上并不少见。性病传播85%是通过紧密的性接触，其他是通过血液、母婴或介质传播，其中介质传播是一个很重要的途径，在医学教科书上就一直有通过洗浴或座便器传播梅毒的病例。
其实，生活中我们经常会发现类似的现象：如果一个公共卫生间里既有蹲式马桶又有座便器，总有人执着地排队等待上蹲式的。还有人见到商场饭店里的座便器就发怵，正琢磨着如何既解了内急又不和座垫“亲密接触”，却发现早有前人在上面踩出两个黑脚印——将座式改为蹲式。
担心传染上疾病是这些人共同的顾虑，即便在美国，也有74%的人相信马桶会传播性病。医生解释说，性病的病菌附着在皮肤的皮屑上，如果性病患者接触了马桶，皮屑就可能脱落，沾在马桶表面，而下一个人直接接触了马桶，就会因此传染上性病。更为关键的是，这些病菌有较长的存活时间，淋病细菌能活24小时，性病病毒更长，为2~3天。而现在发病率呈明显上升趋势的疱疹，因为不光出现在生殖器上，同样存在于臀部，所以与座便器的接触面更大。
一般这些性病的细菌与病毒在超过人体体温和80%的湿度时，就会死亡。所以正规的公共场所，如果保证消毒清洗，就不会有问题。当然，自我保护的意识也是要有的。首先应该养成便前洗手的好习惯，因为性病可能通过手传染到身体的其他部位，如果用被污染的手揉眼睛，那么眼睛也会患淋病。另外，可以在上公共厕所时用纸巾将垫圈擦拭一下，具有消毒功能的湿纸巾更好。还要注意在公共卫生间不要到处乱摸，保证手部清洁。如果条件允许，可以使用一次性的马桶垫圈。
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